Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdxdc1Q99K01 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdxdc1Q99K01 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms