Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Def8Q99J78 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms