Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Cldn16Q925N4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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