Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms