Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb6Q922F4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms