Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApofQ91V80 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms