Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx18Q8VDS8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms