Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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