Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms