Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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