Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms