Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms