Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930572O03RikQ8C5Y0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930572O03RikQ8C5Y0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms