Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cldn17Q8BXA6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cldn17Q8BXA6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn17Q8BXA6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms