Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc18a2Q8BRU6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms