Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

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Length 1,127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc2Q8BMQ3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms