Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms