Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2q1Q7TSS2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms