Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trappc6aQ78XR0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trappc6aQ78XR0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trappc6aQ78XR0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trappc6aQ78XR0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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