Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms