Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc148Q6P5U8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc148Q6P5U8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms