Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms