Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1Q6NXH3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms