Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2cQ69ZS6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sv2cQ69ZS6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sv2cQ69ZS6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2cQ69ZS6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms