Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcncQ62447 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms