Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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