Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms