Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna2Q61301 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms