Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms