Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thoc6Q5U4D9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thoc6Q5U4D9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms