Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frem3Q5H8B9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms