Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms