Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms