Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms