Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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