Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edc4Q3UJB9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms