Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms