Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LchnQ3UHG7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LchnQ3UHG7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms