Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx27Q3UHD6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms