Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms