Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms