Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt2Q3TTY5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt2Q3TTY5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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