Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prr27Q3SYJ2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms