Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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