Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Spatc1Q148B6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spatc1Q148B6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms