Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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