Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq1Q0P5X1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrriq1Q0P5X1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrriq1Q0P5X1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrriq1Q0P5X1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrriq1Q0P5X1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrriq1Q0P5X1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms