Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gata4Q08369 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms