Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms