Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn2Q08093 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms